Quelques jours après l'annonce de la mort de Léonard de Vinci, Ezio, vieil ami de l'inventeur, est contacté par une cellule de l'Ordre des Assassins dont Léonard de Vinci était un proche. Il doit les aider à décoder une mystérieuse lettre qui contiendrait les dernières volontés de l'artiste. Un jeu avec trois scénarios rejouables et neuf fins possibles.